Tras perder a sus padres en la India a causa de una epidemia, Mary Lennox, una niña de nueve años insoportable y malcriada, viaja a Inglaterra para ir a vivir con su tío, Archibald Craven, que no parece dispuesto a mostrar ningún tipo de interés por ella. Por si fuera poco, el nuevo hogar de Mary es una mansión perdida en medio de la nada, con más de cien habitaciones, la mayoría de ellas cerradas bajo llave.
Solo Martha, la joven criada de la casa, parece dispuesta a perder el tiempo con Mary, contándole cosas sobre la casa, los campos que la rodean y un misterioso jardín cerrado desde hace años; tantos que ya nadie recuerda exactamente dónde está.